- BAC/PAC ショットガン・シークエンス
- BACライブラリーのポジショナルクローニングで、前後あわせて300kbpにターゲットを絞り込むことができます。
これにショットガン・シークエンスによるドラフト解析を加えればヒト、マウスでは完全なデータができます。
また、他の動植物でも、未知遺伝子や近傍遺伝子などの発見が期待できます。
- [受託概要]
目的遺伝子を含むBAC／PACクローンをお送りいただければ、BACの増幅、DNA抽出・精製からショットガン・シークエンス、
遺伝子解析まで受託いたします。
尚、ショットガン用BAC・DNAは、大腸菌DNAを排除するためにパルスフィールド電気泳動で精製します。
新規ゲノム ： 種BACのドラフトシークエンスをもとにマッピング。
約300kb のウォーキングができる（Sequence Tagged Connector法）。
[ご注文]
BAC を含む大腸菌クローンを、グリセロール・ストック、あるいはプレートに塗布してお送りください。
[標準仕様]
1) 大量培養で得たBAC・DNAを超音波でランダムに切断し、平均0.5～2kbに切断する。
pUCアームに挿入しショットガンライブラリーを作成する。
2) BAC鎖長の5倍量が読み取れる鋳型クローンを増幅・精製し、 ABIシークエンサーで塩基配列を読取る。
3) データベース検索で遺伝子を同定する。
[送付]
解析データは、CDで送付します。